Учeныe победят COVID-19 близ помощи интернета
Опубликованно 25.09.2020 13:30
Исслeдoвaтeли сo всeгo мирa стaли нa шaг ближe к лучшeму пoнимaнию COVID-19 блaгoдaря двa нoвым вeб-рeсурсaм, рaзрaбoтaнным исслeдoвaтeлями изo Мeдицинскoгo кoллeджa Бeйлoрa и Кaлифoрнийскoгo унивeрситeтa в Сaн-Диeгo. Рeсурсы нaxoдятся в свoбoднoм дoступe свeрx прoeкт сигнaльныx путeй (Baylor) и тeнeтный oбмeн дaнными (UCSD). Oни прeдoстaвляют исслeдoвaтeлям инфoрмaцию o клeтoчныx гeнax, свeрxу экспрeссию кoтoрыx влияeт кoрoнaвируснaя флoрa, и пoмeщaют сии дaнныe в кoнтeкст слoжнoй птицеловные: верх молекулярных сигнальных путей хозяина. Исчерпывание сего ресурса может форсировать разработку новых терапевтических стратегий. Записки опубликовано в журнале Scientific Data.
"Наша мотивация в целях разработки сего ресурса состоит в томище, с тем сделать исследования о COVID-19 мощнее доступными для научного сообщества. При случае-нибудь исследователи имеют явный посещение к работам друг друга, открытия продвигаются больше эффективно", - сказал приневоливающий автор доктор Нил МакКенна, бывалый сотрудник профессор молекулярной и клеточной биологии и мужское (нарицательная) стоимость Комплексного онкологического центра Дэна Л. Дункана в Бейлоре.
В процедура многих лет научное фаланга создавало и архивировало наборы молекулярных данных, документирующих, вот вкусе гены выражаются в процессе выполнения клетками своих обычных функций либо в сношения с заболеванием. Однако нормально буква информация труднодоступна.
В 2019 году Маккенна и его коллеги разработали диаграмма Signaling Pathways - веб-платформу, которая объединяет наборы молекулярных данных, опубликованные в научной литературе, в согласованные регуляторные сигнатуры протока то, что они называют консенсомами, которые ранжируют гены в соответствии с их скоростью дифференциальной экспрессии.
В текущем исследовании исследователи сгенерировали консенсомы пользу кого генов, затронутых инфекцией тремя основными коронавирусами, коронавирусом ближневосточного респираторного синдрома (MERS) и коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома 1 (SARS1) и 2 (SARS2, вызывающим COVID-19).
Маккенна и его коллеги предоставляют эвенту, который помогает исследователям максимально результативно использовать наборы данных о коронавирусе. Выигрыш определяет гены, экспрессия которых в наибольшей степени подвержена влиянию инфекции, и объединяет эти ответы с данными о молекулярных сигнальных путях клеток, в некотором смысле получая лучшее менструация о том, что происходит в середке клетки, инфицированной коронавирусом, и о компиляция, как клетка реагирует.
"Содействие с UCSD делает наши анализы доступными в виде сам не сознавая понятных сетей", - говорит МакКенна. "Вследствие использование этих ресурсов бездоходный требует обучения метаанализу, они имеет принципиальное значение снижают барьеры для благоустроенность использования лабораторными исследователями".
Исследователи объясняют, до какой причине консенсусная политика может (про)явить досель нераспознанные связи не ведь — не то обеспечить дополнительную поддержку подозреваемых связей в кругу коронавирусной инфекцией и сигнальными путями человека, как как в конечном итоге упростит генерацию гипотез дабы проверки в лаборатории.
Например, объединение между беременностью и восприимчивостью к COVID-19 было мудрено оценить из-за отсутствия клинических данных, уж на что молодец есть у вас подход Маккенны и его коллег позволил по-новому взглянуть на эту загадку.
"Песенник этих строк нашли доказательства того, кое-чего передача сигналов рецептора прогестерона антагонизирует индуцированную SARS2 воспалительную передачу сигналов, опосредованную интерфероном в эпителии дыхательных путей. Это открытие предполагает гипотезу о томишко, ась? подавление интерферонового ответа поверху инфекцию SARS2 повышенным уровнем циркулирующего прогестерона золото время беременности может споспешествовать бессимптомному клиническому течению", - сказал Маккенна.
В соответствии с их гипотезой, доколе)) эта статья находилась в рассмотрении, было запущено клиническое проба для оценки прогестерона безошибочно средства лечения COVID-19 у мужчин.
Напомним, допрежь того сообщалось, как Исследователи коронавируса получили невероятные вычислительные мощности.
Хотите объемлить важные и актуальные новости в первую хронология всех? Подписывайтесь на Bigmir)net в Facebook и Telegram.
Категория: В мире
